Пеларгония душистая — представительница большой группы пеларгоний, гак называемых душистых "гераней". Эти растения близкие родственники гераней (род Geranium), распространенных в Европе, и вместе с ними относятся к семейству гераниевых (Geraniaceae). Цветки у пеларгоний собраны в многоцветковые зонтиковидные соцветия и имеют 5 чашелистиков и 5 лепестков, из которых три передних значительно крупнее двух задних.